MSAP

发布时间:2022-08-19浏览次数:2661

甲基化敏感扩增多态性 ,它是在扩增片段长度多态性技术的基础上建立起来的 。MSAP技术相对其他测定DNA甲基化程度技术有如下优点:

(1)不需知道被测DNA的序列信息   ,在不同生物上具有通用性  ,可用于DNA序列背景知识未知的生物。

(2)操作相对简便 ,在AFLP技术体系的基础上不需要太大改进  ,即可操作。

(3)可在全基因组范围检测CCGG位点的胞嘧啶甲基化变化 。MSAP技术的局限性在于不能完成非CCGG位点的胞嘧啶甲基化   。

MSAP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测,传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳(FISH)进行检测。

PAGE方法主要是优点是引物可以是普通引物,适用于少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适  ,另外还可以对差异条带进行克隆测序  ,获得差异条带的序列信息。

毛细管电泳检测方法的优点是自动化,可以对大量样本进行实验,速度快,后期的条带读取可以依靠软件  ,降低了人为读取的标准不一   。

1)MSAP服务内容

1 样本基因组DNA的提取

2 筛选多态性较好的引物(酶切 ,预扩 ,选择性扩增)

3-1 在ABI3730xl测序仪上完成数据采集

3-2 或是在JY-CX2B型 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

数据分析:和客户详细沟通 ,确认分析方案  :读取01矩阵 ,PAGE胶建议客户自己读取;

2)客户提供  :

★ 基因组DNA:

●至少15μL样品 ,浓度为50-100ng/μL;

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带 ,没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

★ 植物材料 : 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

★ 动物材料: 新鲜组织 ,无水乙醇封存低温运输;

3)试验费用  :


MSAP 毛细管电泳检测按照96个样本进行随机8对引物计算 ,提供01矩阵
项目单价数量金额
DNA提取30962880
引物30000
酶切401927680
预扩151922880
选择性扩增10153615360
毛细管检测8001612800
读带、分析

议价
合计

41600
MSAP PAGE电泳检测按照25个样本进行随机8对引物计算  ,提供PAGE胶图
项目单价数量金额
DNA提取3025750
纯化1025250
酶切40502000
预扩1550750
选择性扩增104004000
PAGE检测80086400
读带 、分析

议价
合计

14150

MSAP1

MSAP2



返回顶部

网站地图